现代中药研究所于2005年组建，由药学院从事中药研究的教师组成，下设中药资源学、中药药理学、中药分析与代谢、中药新药等四个研究室。研究所现有教师11人，其中教授2人，副教授5人，教学、科研队伍中具有博士学位的教师约占70%。中国工程院院士李连达教授为研究所主要学术带头人。招收中药学和药物分析学硕士研究生、药理学和药物分析学博士研究生。
研究所强调基础研究和应用研究相结合，一方面注重学科前沿的研究和高素质人才的培养，另一方面重视中药新药的研发等应用研究，为国家和地方的建设与经济发展服务。近两年来，先后承担了国家973项目、“十五” 国家科技攻关项目、国家自然科学基金项目等课题，以及一大批省部级基金、攻关和重大横向项目等。近年来发表论文60余篇，其中SCI、EI收录40余篇，获国家科技进步二等奖1项，其他省部级科技成果奖多项。